因为先前读过一些涉及进化论的书，比如卡尔·齐默的《演化》，理查德·道金斯的《自私的基因》，甚至是戴德蒙的《枪炮、病菌与钢铁》，所以这本书给人的冲击并不算大，就大的框架来讲大部是已经知道的。记录一些小的地方吧。

1. 演化有两个主要方面的证据，一个是我们现在广为认知的生物化石，另外则是胚胎学的。几乎所有我们熟知的动物，不管它们的形态与人类有多大的不同，初始的胚胎都是极为相似的；胚胎会在后面的发育中经历一系列看上去并不自然的改变以变化成要生成的物种。这一过程并不像一般人想当然以为的那样胚胎一开始便应该是它所要成的物种的样子–猪的胚胎一开始就是小猪，鸡的胚胎一开始就是小鸡，人的胚胎一开始就是小人–事实上猪、鸡还是人，它们一开始都更像是小鱼：）达尔文在写作《物种起源》时将胚胎学的发现作为进化论最为有力的证据，而不是当时还不算非常充足的化石。

2. 化石的形成需要极为苛刻的条件，而且生物柔软的部分很难形成化石，因而像水母这种动物和绝大多数的植物，都难有化石发现；而且在发现的化石中，也往往只能是看到生物的主要骨架，而柔软的皮毛血肉部分则消失不见。因而在我们的生物进化树上，能够有化石证据的占的比例相当少，而且越是最古老的越为难得（比如细菌之类）。所幸的是生物的进化是一个连续的过程，尽管找到进化树上重要的分叉点，即所谓的”缺失环节”,并不是件容易的事情，但起相关联的近亲的发现也能在一定程度上达成我们的研究目的。

3. 生物进化树的特点在于，任给历史上存在过的两个物种，必有它们的共同祖先存在。这虽然于数学上来讲是简单的事实，仔细去想所有可能的大约在几千万到几十亿可能的物种这种大的规模，实在还是件让人震撼的事情。

4. 进化的另一个证据是返祖现象。有的婴儿生下来是带有尾巴的，这个尾巴是人类的祖先曾经有过但现在已经退化了的。

5. 生物体内某个组织的功能退化一方面是进化的证据，另一方面也在说明进化所造就的生物并不是在严格意义上设计最优的。假若从零开始设计完美的人类，我们也许就不会有阑尾，有更强健的坐骨和更好的视力来适应现代人更多时间坐在电脑前面的事实吧。因为适应环境进行一点点的修修补补而最终造就成的人类，也许就无须去太过赞扬自己身体的完美了。

6. 现有生物的地理分布也是进化论表现其威力的一个重要方面。结合大陆漂移学说，在不同大陆和岛屿上的生物物种的特异性可以很完美的用进化论来解释。

7. 存在着这样的可能–虽然这个可能极小–我们的世界受着超自然力量的控制。如果相信了这个，事情是简单了：碰到任何需要解释的事情，只要拿出这样的挡箭牌来，一切也就妥贴了：”这是神的旨意”。可是这个实在是对人类自己的理性自弃了–也实在是有些太消极，没有科学的进取了。